日本宇宙科学研究所（Institute of Space and Astronautical Science，ISAS）是日本发射火箭，天文卫星和星际探测器的国家研究机构。自2003年以来，它是日本宇宙航空研究开发机构旗下一个部门。
日本宇宙航空研究所起源于日本东京大学工业科学研究所，在20世纪50年代，丝川英夫尝试发射小型固体燃料火箭。这个实验最终导致推出卡帕探空火箭，它被用于观测活动。到1960年时，K-8火箭已经可以发射到200公里的高度。
1964年，日本火箭组，航空研究所和科学气球团队在东京大学内合成为日本航天科学研究所。火箭逐渐演变为L（拉姆达）系列，并在1970年，L-4S-5作为日本第一颗人造卫星大隅。
1981年，随着日本高校体制改革的一部分，为了其使命而从东京大学分拆出来成为日本国家级大学研究机构 - 日本宇宙科学研究所。
